Содержание
Язык R
ToDo статьи:
- привести в нормальное состояние примеры --АтрашкевичАндрей
- написать про data.frame --АтрашкевичАндрей
- Написать про help() --ЛипинБорис
- Написать про поддержку векторизации вычислений --ЛипинБорис
- привести примеры статистических функций --АтрашкевичАндрей
- привести в нормальное состояние список литературы --АтрашкевичАндрей
- коллеги, пожалуйста проверьте исправленный список литературы --АтрашкевичАндрей
- добавить сравнение с другими языками программирования, используемыми преимущественно для целей статистики --АтрашкевичАндрей
Общее описание языка R
R — простой и полезный язык для статистики, машинного обучения и DataMining, распространяемый по лицензии GNU GPL 2.
Главная страница проекта: http://www.r-project.org/
Скачать бинарники R можно здесь (российское зеркало): http://cran.gis-lab.info/ (доступны версии для UNIX (Linux), Windows, OS X). Пользователям Ubuntu и Debian скачивать ничего не нужно: можно установить пакеты r-base, r-base-dev, r-base-cor:
$ sudo apt-get update && apt-get install r-base r-base-dev r-base-core
Более подробно об установке R можно прочитать тут http://cran.r-project.org/doc/manuals/r-release/R-admin.html
История создания
В 1976 году сотрудники AT&T Bell Labs: Джон Чамберс, Рик Беккер и Алан Вилкс — создали язык программирования S (от англ. «statistics»).
В 1993 году в стране, где на десять жителей приходится двадцать овец, три хоббита и два эльфа, двумя сотрудниками Оклендского университета Россом Ихака и Робертом Джентльменом (это не шутка-) на основе языка S был разработан язык R. Язык, как и его предшественник, был разработан преимущественно для статистических целей, а его название было, во-первых, подражанием названию языка S, во-вторых, это была первая буква имен разработчиков (несмотря на то, что полное имя Росса Ихака — Джордж Росс Ихака). Разработчик языка S Джон Чамберс входит в R Core Team.
Соглашения оформления кода
- Оператор присвоения <- вместо =.
- Имена переменных записываются в lowerCamelCase, например: monthlyAnnuity, numberOfIterations.
- Имена функция в UpperCamelCase: CalculateAnnuity, GetNextValue, SubstractUniqueSubstrings.
- В некоторых случаях, когда это целесообразно, используется венгерская нотация: vPayments — вектор, dfPayments — таблица (data.frame).
Программа «Hello, world!»
Для присвоения переменной значения в R используется оператор <-. Оператор = также поддерживается, но не соответствует соглашениям. Поэтому во всех дальнейших примерах использовует только оператор <-.
> hw <- "Hello, world!" > + print(hw) \[1] "Hello, world!"
R чувствителен к регистру, поэтому будьте внимательны и соблюдайте соглашения оформления кода.
> hw <- "Hello, world!" > + print(HW) Ошибка в print(HW) : объект 'HW' не найден
Оператор присвоения работает в обе стороны, поэтому можно писать как <-, так и ->.
# в R нет многострочных комментариев > "Hello, world!" -> hw > + hw # такой способ работает только в интерактивном режиме \[1] "Hello, world!"
Иногда удобно вывести на печать переменную сразу после присвоения значения. Для этого используется заключение операции присвоения в круглые скобки. Подобная конструкция возможна также только в интерактивном режиме.
> (hw <- "Hello, world!") \[1] "Hello, world!"
R — скриптовый язык, поэтому остальные примеры будут даваться как запись скриптов.
R как калькулятор
Все имеющиеся т.н. «статистические» пакеты можно условно разделить на три категории:
- библиотеки высокоуровневых ЯП (Seismic UNIX в Си, Pandas в Python) и специализированные языки для математических (включая статистические) вычисления: GNU Octave, Julia, MATLAB, MATCAD
- «взбесившиеся» научные калькуляторы: помимо R к ним относятся Gretl (GNU Regression, Econometrics and Times-series Library), GAUSS, EViews.
- «взбесившиеся» табличные процессоры: работа с ними напоминает MS Excel, у которого оставили только VBA-редактор (например, SAS Base — фактический стандарт в банковской и страховой индустриях, STATA или Statistica) или существенно урезали возможности редактирования редактирования ячеек и «кнопочные» функции и меню (SPSS и SAS Enterprise Guide).
R можно использовать как хороший научный и статистический калькулятор.
С его помощью можно выполнять элементарные арифметические действия:
%NF 2 + 2 %NE
\[1] 4
Можно выполнять чуть более сложные:
12 + 5 * (3 - 7) + 24 / 4.8 \[1] -3
Можно работать через переменные:
a <- 2 b <- 3 (c <- a + b) (c <- c + 6) \[1] 5 \[2] 11
А можно использовать и для довольно сложных вычислений. В примере - вычисление значения функции Гомпертца.
a <- 0.993 # верхняя ассимптота b <- -2.63 # смещение по t d <- -1.257 # масштабированием по t t <- 6.2567 # момент времени gompertzValue <- a * exp(b * exp(d * t)) # функция cat() объединяет свои аргументы в одну строку # "\n" означает перевод каретки на новую строку > + cat("Gompertz Value = ", gompertzValue, "\n") Gompertz Value = 0.9919975
Векторы
Векторы в R — один из наиболее часто используемых объектов. Вектор в R понимается не как элемент векторного пространства (то есть не в строгом математическом смысле), а как набор однородных данных. Можно сказать, что вектор в R — массив (или контейнер) однородных данных.
Для инициализации переменной-вектора кроме оператора присвоения <- используется также оператор c(). С его помощью можно создать любой вектор, включая «пустой», т.е. не содержащий ни одного значения. Длина такого вектора будет равняться нулю.
(vec.empty <- c()) NULL length.of.vec.empty <- length(vec.empty) length.of.vec.empty \[1] 0
Вектор можно задать простым перечислением его элементов.
vec.first <- c(1, 5, 12, 6.78, 5.4645) vec.first \[1] 1.0000 5.0000 12.0000 6.7800 5.4645
Нумерация элементов вектора начинается с 1, а не с 0, как, например, в Си (а также во многих других языках программирования). Чтобы указать определенный элемент или элементы вектора используются квадратные скобки.
vec.first <- c(1, 5, 12, 6.78, 5.4645) vec.first\[1] \[1] 1 vec.first\[4] \[1] 6.78 vec.first\[2:4] \[1] 5.00 12.00 6.78
Векторы имеют фундаментальное значение в R. Например, в циклы в R проходят по элементам вектора. Поэтому есть еще один способ задания векторов.
vec.one.to.five <- 1:5 vec.one.to.five \[1] 1 2 3 4 5
Однако, лучше всё же явно указывать, что происходит объявление вектора. Исключение состоявляют только простейшие циклы.
vec.seven.to.eleven.without.eight <- c(7, 9:11) vec.seven.to.eleven.without.eight \[1] 7 9 10 11
vec.one.to.ten.without.six.and.eight <- c(vec.one.to.five, vec.seven.to.eleven.without.eight\[1:3]) vec.one.to.ten.without.six.and.eight \[1] 1 2 3 4 5 7 9 10
При указании элементов вектора в квадратных скобках можно указывать вектор, задающий индексы.
vec.one.to.ten.without.six.and.eight\[c(1, (5:7))] \[1] 1 5 7 9
Числа в R - это вектора единичной длины. Именно в этом смысле стоит понимать широко распространенную фразу, что в R нет числовых скаляров. В реальности скаляры в R присутствуют (например, возможные значения булевых переменных: TRUE и FALSE).
Числовые вектора в R — важный, но частный случай. Вектор, как контейнер данных, может хранить и нечисловые значения. Можно задать вектор, состоящий из строк.
vec.second <- c("one", "two", "three") vec.second\[2] \[1] "two"
Если в векторе встречаются и строки, и числа, то все элементы вектора, будут строками
str.vec <- c(1, "two", 3) # функция is.numeric() возвращает ИСТИНА, если ее аргумент - число, иначе ЛОЖЬ is.numeric(str.vec\[1]) FALSE
Функции, ветвления и циклы
Синтаксис любой функции в R выглядит следующим образом:
FunctionName <- function(<argument.1> <, argument.2> <, ...>){ # code <return(value.to.return)> }
Можно использовать упрощенный синтаксис (что делать крайне не советую — АтрашкевичАндрей)
FunctionName <- function(<argument.1><, argument.2><, ...>){ # code here
Показан только синтаксис, соответствующий объявленным выше соглашениям оформления кода.
# квадрат числа FuncSquareOfTheNumber <- function(x) x^2 value.for.func.one <- 2.75 result.of.func.one <- FuncSquareOfTheNumber(value.for.func.one) \[1] 7.5625
# экспонента числа минус его куб FuncExpMinusCube <- function(x){ result <- exp(x) result <- result - x**3 # степень можно записать и как "^", и как "**" return(result) } FuncExpMinusCube(6.5)
Вычисление факториала
Синтаксис цикла for:
for(iterator.name in start.value:stop.value){ # code }
Если необходимо задать шаг итерации, то запись несколько отличается:
for(itarator.name in seq(start.value, stop.value, by = by.value)){ # code }
# инкрементное решение
%NF FuncFactorialIteraion? <- function(n){
stopifnot (n > 0) # если условие в скобках не ИСТИНА, значит прекращается исполнение factorial <- 1 for (i in 1:n) { factorial <- factorial * i } return(factorial)} FuncFactorialIteraion?(5) %NE
Для проверки условий ветвлений используются логические выражения (принимающие одно из возможных значений: ИСТИНА или ЛОЖЬ). Для записи логических выражений используются логические операторы И, ИЛИ, НЕ. В синтаксисе R: &, |, ! — соответственно.
Синтаксис ветвления:
#condition.1, ..., condition.N - логические выражения if (condition.1) { # code если условие condition.1 - ИСТИНА } else if (condition.2) { # code если условие condition.2 - ИСТИНА # ... } else if (condition.N) { # code если условие condition.N - ИСТИНА } else { # code если condition.1 ... condition.N все ЛОЖЬ }
# рекурсивное решение
%NF FuncFactiorialRecur? <- function(n) {
stopifnot (n >= 0) if (n == 0) { return(1) } else { return(n * FuncFactiorialRecur?(n - 1)) #вызов функции из самой себя }} FuncFactiorialRecur?(4) %NE
Числа Фибоначчи
%NF
# последовательность Фибоначчи F = {0, 1, 1, 2, 3, 5, 8, 13, 21, 34, 55, 89, 144, ...}FuncFibonacci? <- function(n) {
stopifnot (n > 0) if (n == 1) { return(0) } else if (n == 2) { #обратите внимание на пробел между else и if return(1) } else { return(FuncFibonacci?(n - 1) + FuncFibonacci?(n - 2)) }} FuncFibonacci?(8) %NE
Использование языка
Сравнение с другими языками
Следующей монокультурой в пространстве статистических языков программирования по моим прогнозам (АтрашкевичАндрей) должен стать язык Julia. Уже есть некоторые указания на то, что этот процесс запущен и идет. Например, Julia начинают пиарить в «илитных» ВУЗах и факультетах по математическим методам в экономике и по прикладной математике в экономике. До R монокультурой был EViews (пиарился эконометристами РЭШ) и, частично, gretl (пиарился эконометристами ВШЭ). Монокультурой на ПМ-ПУ СПбГУ (привсем уважении) был, есть и остается MATLAB (и его детище SimuLink). Хотя 98% «экономистов» дальше =СУММЕСЛИ() в MS Excel вообще ничего никогда не используют.
Литература
- R Language Definition. Version 3.1.2 (2014-10-31) DRAFT / R Core Team. — 2014. — 60 p. — http://cran.r-projec....
- Venables, W. N. An Introduction to R. Notes on R: A Programming Environment for Data Analysis and Graphics. Version 3.1.2 (2014-10-31) / W. N. Venables, D.M. Smith, Core Team R. — W. N. Venables, D. M. Smith and the R Core Team, 2014. — 105 p. — http://cran.r-projec....
- Paradis, E. R for beginners / E. Paradis. — 2005. — 72 p. — http://cran.r-projec....
- Matloff, N. The Art of R Programming / Norman Matloff. — 2009. — 193 p. — http://heather.cs.uc....
К: The Art of R Programming — книга для тех, кто знаком (и знаком неплохо) с программированием. В ее приложениях находится хороший список литературы, включая ссылки на интернет-источники. --АтрашкевичАндрей
КатегорияЯзыкиПрограммирования